El distrito de Garakilsa se formó el 9 de septiembre de 1930. El centro del distrito, con una superficie de 1719 km², era la ciudad de Karakilsa. La ciudad de Iravan se encuentra a 217 km.

Debido a su ubicación geográfica, el distrito de Karakilsa está rodeado por cuatro lados por las cordilleras Zangezur y Bergushad. El río Bazarchay discurre por el distrito.

El territorio del distrito históricamente formó parte del Condado de Zangezur del kanato de Iravan, y durante la Rusia zarista, del Condado de Zangezur de la provincia de Yelizavetpol (Ganyá).

Por decreto del Presidium del Soviet Supremo de la RSS de Armenia del 2 de marzo de 1940, el nombre del distrito fue cambiado a “Sisian”.

Desde 1987, los azerbaiyanos indígenas de la región se han visto obligados a abandonar sus lugares de residencia. En 1995, el distrito fue suprimido e incorporado en el territorio administrativo de la provincia de Syunik de Armenia.